| 醫政業務 |
21、26 |
- 醫療機構管理、緊急醫療業務（分機21）
- 精神心理衛生、自殺防治、社區精神病人追蹤照護管理（分機26）
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| 食品業務 |
21 |
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| 藥政業務 |
15 |
- 藥政稽查、宣導及抽查業務、管制藥品業務、門診醫療藥品管理
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| 長期照護 |
21、27 |
- 個案管理、長期照護轉介單、服務品質監測、長照服務管理、人員訓練、加強民眾長期照顧認知及相關教育宣導
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| 傳染病防治業務 |
21、24 |
- 傳染病監測及疫情處理、傳染病防治、志工動員（分機21）
- 登革熱防治、腸病毒及腸道水患相關傳染病防治（分機24）
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| 愛滋病管理及防治 |
14 |
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| 結核病管理及防治 |
24 |
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| 預防接種防治 |
22 |
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| 衛生保健計畫 |
20 |
- 健康體能暨代謝症候群及肥胖防治、健康老化、推動慢性病照護網、癌症篩檢與檳榔健康危害防制、營造母嬰親善的哺乳環境、嬰幼兒保健、新生兒聽
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